Игра основана на сюжете первой части игры: Лара Крофт, нанятая могущественным синдикатом для поисков мифического предмета под названием Сцион. Берет дело в свои руки и самостоятельно раскрывает тайну, стоящую за этим древним артефактом из таинственной Атлантиды. Действие разворачивается в тех же локациях, что и в Tomb Raider I - Египет, Греция, Атлантида и Перу, все ключевые моменты сюжета оригинальной версии будут сохранены.